Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VarsQ9Z1Q9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms