Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx39bQ9Z1N5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms