Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gbp2Q9Z0E6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp2Q9Z0E6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp2Q9Z0E6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp2Q9Z0E6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp2Q9Z0E6 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp2Q9Z0E6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp2Q9Z0E6 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp2Q9Z0E6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp2Q9Z0E6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp2Q9Z0E6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp2Q9Z0E6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp2Q9Z0E6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp2Q9Z0E6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp2Q9Z0E6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp2Q9Z0E6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp2Q9Z0E6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms