Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVG6

Carm1, Histone-arginine methyltransferase CARM1, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carm1Q9WVG6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Carm1Q9WVG6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Carm1Q9WVG6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Carm1Q9WVG6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Carm1Q9WVG6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Carm1Q9WVG6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Carm1Q9WVG6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Carm1Q9WVG6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Carm1Q9WVG6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Carm1Q9WVG6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Carm1Q9WVG6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Carm1Q9WVG6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Carm1Q9WVG6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Carm1Q9WVG6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Carm1Q9WVG6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Carm1Q9WVG6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Carm1Q9WVG6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Carm1Q9WVG6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Carm1Q9WVG6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Carm1Q9WVG6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Carm1Q9WVG6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms