Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnip1Q9WUU8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnip1Q9WUU8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms