Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Lhx9Q9WUH2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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Lhx9Q9WUH2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Lhx9Q9WUH2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Lhx9Q9WUH2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Lhx9Q9WUH2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx9Q9WUH2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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