Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfwd2Q9R1A8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms