Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms