Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ubxn8Q9QZ49 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms