Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc2lQ9JME7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc2lQ9JME7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc2lQ9JME7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc2lQ9JME7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc2lQ9JME7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc2lQ9JME7 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc2lQ9JME7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc2lQ9JME7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc2lQ9JME7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc2lQ9JME7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc2lQ9JME7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc2lQ9JME7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc2lQ9JME7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc2lQ9JME7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc2lQ9JME7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc2lQ9JME7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc2lQ9JME7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc2lQ9JME7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc2lQ9JME7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc2lQ9JME7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc2lQ9JME7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc2lQ9JME7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc2lQ9JME7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc2lQ9JME7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc2lQ9JME7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc2lQ9JME7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc2lQ9JME7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc2lQ9JME7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc2lQ9JME7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc2lQ9JME7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc2lQ9JME7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc2lQ9JME7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc2lQ9JME7 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc2lQ9JME7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc2lQ9JME7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc2lQ9JME7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms