Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms