Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SrfQ9JM73 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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