Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cabp1Q9JLK7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cabp1Q9JLK7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms