Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chrac1Q9JKP8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms