Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Nova1Q9JKN6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Nova1Q9JKN6 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nova1Q9JKN6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nova1Q9JKN6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nova1Q9JKN6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nova1Q9JKN6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nova1Q9JKN6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nova1Q9JKN6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nova1Q9JKN6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nova1Q9JKN6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nova1Q9JKN6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nova1Q9JKN6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nova1Q9JKN6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nova1Q9JKN6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nova1Q9JKN6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms