Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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