Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ybx3Q9JKB3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms