Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfhx4Q9JJN2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfhx4Q9JJN2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfhx4Q9JJN2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfhx4Q9JJN2 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfhx4Q9JJN2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfhx4Q9JJN2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfhx4Q9JJN2 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfhx4Q9JJN2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfhx4Q9JJN2 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfhx4Q9JJN2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfhx4Q9JJN2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zfhx4Q9JJN2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfhx4Q9JJN2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfhx4Q9JJN2 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfhx4Q9JJN2 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfhx4Q9JJN2 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfhx4Q9JJN2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfhx4Q9JJN2 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfhx4Q9JJN2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfhx4Q9JJN2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfhx4Q9JJN2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfhx4Q9JJN2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfhx4Q9JJN2 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfhx4Q9JJN2 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfhx4Q9JJN2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfhx4Q9JJN2 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfhx4Q9JJN2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfhx4Q9JJN2 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfhx4Q9JJN2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfhx4Q9JJN2 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfhx4Q9JJN2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfhx4Q9JJN2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zfhx4Q9JJN2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms