Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad9Q9JIW5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smad9Q9JIW5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms