Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc12a4Q9JIS8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc12a4Q9JIS8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc12a4Q9JIS8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc12a4Q9JIS8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc12a4Q9JIS8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc12a4Q9JIS8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc12a4Q9JIS8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc12a4Q9JIS8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc12a4Q9JIS8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc12a4Q9JIS8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc12a4Q9JIS8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc12a4Q9JIS8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc12a4Q9JIS8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc12a4Q9JIS8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc12a4Q9JIS8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc12a4Q9JIS8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc12a4Q9JIS8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc12a4Q9JIS8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc12a4Q9JIS8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc12a4Q9JIS8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc12a4Q9JIS8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc12a4Q9JIS8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc12a4Q9JIS8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc12a4Q9JIS8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms