Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rb1cc1Q9ESK9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms