Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hipk3Q9ERH7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hipk3Q9ERH7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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