Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slco1c1Q9ERB5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slco1c1Q9ERB5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slco1c1Q9ERB5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slco1c1Q9ERB5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slco1c1Q9ERB5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slco1c1Q9ERB5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slco1c1Q9ERB5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slco1c1Q9ERB5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slco1c1Q9ERB5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slco1c1Q9ERB5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Slco1c1Q9ERB5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slco1c1Q9ERB5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slco1c1Q9ERB5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slco1c1Q9ERB5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slco1c1Q9ERB5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Slco1c1Q9ERB5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slco1c1Q9ERB5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slco1c1Q9ERB5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slco1c1Q9ERB5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slco1c1Q9ERB5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slco1c1Q9ERB5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slco1c1Q9ERB5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slco1c1Q9ERB5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slco1c1Q9ERB5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slco1c1Q9ERB5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slco1c1Q9ERB5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slco1c1Q9ERB5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slco1c1Q9ERB5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slco1c1Q9ERB5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slco1c1Q9ERB5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slco1c1Q9ERB5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Slco1c1Q9ERB5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slco1c1Q9ERB5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slco1c1Q9ERB5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slco1c1Q9ERB5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slco1c1Q9ERB5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Slco1c1Q9ERB5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slco1c1Q9ERB5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slco1c1Q9ERB5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms