Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Cxcr6Q9EQ16 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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