Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Clstn1Q9EPL2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms