Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP53

Tsc1, Hamartin, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc1Q9EP53 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms