Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufs3Q9DCT2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufs3Q9DCT2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms