Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms