Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR7

Ppp1r12a, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 12A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r12aQ9DBR7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppp1r12aQ9DBR7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp1r12aQ9DBR7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms