Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAE8

UPF0739 protein C1orf74 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAE8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9DAE8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9DAE8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9DAE8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9DAE8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q9DAE8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q9DAE8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q9DAE8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9DAE8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9DAE8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9DAE8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9DAE8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9DAE8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9DAE8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9DAE8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q9DAE8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms