Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc89Q9DA73 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms