Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms