Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl4Q9D8E6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms