Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ifi35Q9D8C4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifi35Q9D8C4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms