Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Cldn22Q9D7U6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Cldn22Q9D7U6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Cldn22Q9D7U6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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