Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc3Q9D6Y1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc3Q9D6Y1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms