Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3a3Q9D554 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms