Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syce1Q9D495 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms