Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms