Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms