Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2D9

Klhdc8b, Kelch domain-containing protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc8bQ9D2D9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhdc8bQ9D2D9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms