Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chordc1Q9D1P4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms