Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tspan11Q9D1D1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms