Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M1

Prpsap1, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap1Q9D0M1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpsap1Q9D0M1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpsap1Q9D0M1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms