Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms