Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gtf2e1Q9D0D5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2e1Q9D0D5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms