Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

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Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PmpcbQ9CXT8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PmpcbQ9CXT8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PmpcbQ9CXT8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PmpcbQ9CXT8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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PmpcbQ9CXT8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PmpcbQ9CXT8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PmpcbQ9CXT8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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PmpcbQ9CXT8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PmpcbQ9CXT8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PmpcbQ9CXT8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PmpcbQ9CXT8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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PmpcbQ9CXT8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PmpcbQ9CXT8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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PmpcbQ9CXT8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PmpcbQ9CXT8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PmpcbQ9CXT8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PmpcbQ9CXT8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PmpcbQ9CXT8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PmpcbQ9CXT8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PmpcbQ9CXT8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PmpcbQ9CXT8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PmpcbQ9CXT8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PmpcbQ9CXT8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PmpcbQ9CXT8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PmpcbQ9CXT8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PmpcbQ9CXT8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms