Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Xrcc3Q9CXE6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Xrcc3Q9CXE6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Xrcc3Q9CXE6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Xrcc3Q9CXE6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Xrcc3Q9CXE6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Xrcc3Q9CXE6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Xrcc3Q9CXE6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Xrcc3Q9CXE6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Xrcc3Q9CXE6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Xrcc3Q9CXE6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Xrcc3Q9CXE6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Xrcc3Q9CXE6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Xrcc3Q9CXE6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Xrcc3Q9CXE6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Xrcc3Q9CXE6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Xrcc3Q9CXE6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Xrcc3Q9CXE6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Xrcc3Q9CXE6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Xrcc3Q9CXE6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Xrcc3Q9CXE6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Xrcc3Q9CXE6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Xrcc3Q9CXE6 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Xrcc3Q9CXE6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Xrcc3Q9CXE6 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Xrcc3Q9CXE6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Xrcc3Q9CXE6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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