Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpusd4Q9CWX4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms