Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWK8

Snx2, Sorting nexin-2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx2Q9CWK8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx2Q9CWK8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms